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Paketbeschreibung


Paketnamesibsim4
Beschreibungalign expressed RNA sequences on a DNA template
Archiv/RepositoryOffizielles Ubuntu Archiv lucid (universe)
Version0.17-1
Sektionuniverse/science
Prioritätoptional
Installierte Größe96 Byte
Hängt ab vonlibc6 (>= 2.4)
Empfohlene Pakete
PaketbetreuerUbuntu MOTU Developers
Quelle
Paketgröße32274 Byte
Prüfsumme MD5992c34205654d4cc83d7e25fea8eaec5
Prüfsumme SHA1f7de98cce575f47a4cd334380dc585a794134b7b
Prüfsumme SHA256cefce8375c1c246054b8d0fa2b33da6ed1cfe1228bc4a0242865e8963df732c2
Link zum Herunterladensibsim4_0.17-1_i386.deb
Ausführliche BeschreibungThe SIBsim4 project is based on sim4, which is a program designed to align an expressed DNA sequence with a genomic sequence, allowing for introns. SIBsim4 is a fairly extensive rewrite of the original code with the following goals: * speed improvement; * allow large, chromosome scale, DNA sequences to be used; * provide more detailed output about splice types; * provide more detailed output about polyA sites; * misc code cleanups and fixes.


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