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Paketbeschreibung


Paketnamesibsim4
Beschreibungalign expressed RNA sequences on a DNA template
Archiv/RepositoryOffizielles Debian Archiv squeeze (main)
Version0.20-1
Sektionscience
Prioritätoptional
Installierte Größe96 Byte
Hängt ab vonlibc6 (>= 2.3)
Empfohlene Pakete
PaketbetreuerDebian Med Packaging Team
Quelle
Paketgröße32854 Byte
Prüfsumme MD5d4289d5c0c998fbae6af88e4cbe35587
Prüfsumme SHA160cd33d947f6a4528b87aede83d2faec58601257
Prüfsumme SHA2561465639f16ab9a009e4d3f1f6ed9ef103405b2061b78736ef2e9c38f9d9b99c8
Link zum Herunterladensibsim4_0.20-1_i386.deb
Ausführliche BeschreibungThe SIBsim4 project is based on sim4, which is a program designed to align an expressed DNA sequence with a genomic sequence, allowing for introns. SIBsim4 is a fairly extensive rewrite of the original code with the following goals: * speed improvement; * allow large, chromosome scale, DNA sequences to be used; * provide more detailed output about splice types; * provide more detailed output about polyA sites; * misc code cleanups and fixes.


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