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Paketbeschreibung


Paketnameamap-align
BeschreibungProtein multiple alignment by sequence annealing
Archiv/RepositoryOffizielles Debian Archiv squeeze (main)
Version2.2-1
Sektionscience
Prioritätoptional
Installierte Größe256 Byte
Hängt ab vonlibc6 (>= 2.7-1), libgcc1 (>= 1:4.1.1-21), libstdc++6 (>= 4.2.1-4)
Empfohlene Pakete
PaketbetreuerDebian-Med Packaging Team
Quelle
Paketgröße127424 Byte
Prüfsumme MD58fac2bbe6121401005521ce3e654f776
Prüfsumme SHA176e8defc782e9c3b8d96cb74a121d14ba890beea
Prüfsumme SHA256d6bc54f8f18408b4fae57d4a16053e72c446a25ee357ff4e18310566c3a9bb1f
Link zum Herunterladenamap-align_2.2-1_i386.deb
Ausführliche BeschreibungAMAP is a command line tool to perform multiple alignment of peptidic sequences. It utilizes posterior decoding, and a sequence-annealing alignment, instead of the traditional progressive alignment method. It is the only alignment program that allows to control the sensitivity / specificity tradeoff. It is based on the ProbCons source code, but uses alignment metric accuracy and eliminates the consistency transformation. . The java visualisation tool of AMAP 2.2 is not yet packaged in Debian.


Impressum
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